鱼池进行药物清塘，是鱼病预防工作上的一项重要措施，滴塘以放养前半个月进行为宜，如清塘过早，药效消失，病原菌又将重生；过迟，则毒性未退，影响鱼苗的生长。为了安全起见，药物清塘后，最好先试养几条鱼，证明毒性确已消失，才可大量放养鱼苗。用于鱼池清塘的药物种类很多。常见效果较好的是生石灰和漂白粉。现将2种药物的使用方法介绍如下：
    1、生石灰清塘法。生石灰化水后成为氢氧化钙，能杀灭害鱼、水生昆虫和细菌等病原体。在鱼池整修后，选择晴天进行生石灰清塘消毒。池中要留4~6厘米深的水层，使泼入的石灰浆能均匀分布。每亩鱼池用生石灰50-75千克，先在池底各处挖掘几个小潭，小潭的数量及其间距，以能泼洒到全池为限。先将生石灰放入小潭中，让其吸水溶化，不等冷却即向四周泼洒，要求全池泼到。次日用长柄泥耙将池底淤泥和生石灰浆调和，以增强清塘的消毒除害作用。
    对于清塘之前不能排水的鱼池，可以进行带水施药，但要根据水体大小增加生石灰用量，平均水深1米的池塘每亩施生石灰125-150千克。将生石灰装入箩筐中，悬挂于一小船边，使箩筐沉入水中，待生石灰吸水溶化后，划动小船，使船在池中缓行，同时摆动箩筐，使石灰浆散入池水之中。次日用泥耙搅动池底淤泥，以提高消除敌害的效果。
    2、漂白粉清塘法。漂白粉遇水释放次氯酸，肖很强的杀菌作用。用于鱼池清塘，每立方米水体施用漂白粉20克，即平均水深1米的池塘，每亩用量为13．5千克。施用时先将漂白粉加水溶化，然后立即遍洒全池，泼完后再用船和竹竿在池中荡动，使药物在水体中均匀分布，以增强强施药效果。使用漂白粉应注意：①泼洒漂白粉药液时，不宜使用金属容器盛装，以免容器被腐蚀和降低药效；②漂臼粉的有效成份达不到30％时，应适当增加用量(失效漂白粉忌用)；③操作人员应戴好口罩、橡皮手套，施药时应站上风处，以防中毒和衣服沾染而被腐蚀。